মোল্লাহাটের উল্লেখযোগ্য নদী মধুমতি ও আঠারোবাকী ।মোল্লাহাট উপজেলা মধুমতি নদীর মাধ্যমে গোপালগঞ্জ হতে আলাদা হয়েছে। নদীর দুই তীর পানি উন্নয়ণ বোর্ড কর্তৃক বেড়ী বাধ নির্মাণ করা আছে। এক সময় এ নদীই ছিল মোল্লাহাট উপজেলায় যোগাযোগের প্রধান মাধ্যম। বর্তমানেও সীমিত আকারে মধুমতি নদীর মাধ্যমে একস্থান থেকে অন্যস্থানে মালামাল পার করা হয়। বর্তমানে এই মধুমতি নদীর পানি দ্বারা কৃষিকাজ করা হয়। অধিকন্তু এই নদীতে অনেক মাছ পাওয়া যায়।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস